Motovunski Novaki ist ein Ort auf einer Anhöhe von 333 m über dem Meeresspiegel, welcher im 13. Jahrhundert das Zentrum der Lehen des Patriarchats von Aquileia war, und im Jahr 1330 verfiel er Motovun und der Venezianischen Republik. Die turbulente Vergangenheit wurde von häufigen Herrscherwechseln geschrieben, und Konflikte mit den umliegenden Gebieten waren unvermeidlich. Das attraktive Gebiet war bereits in der römischen Zeit besiedelt. Im 14. Jahrhundert kamen kroatische Flüchtlinge auf der Flucht vor der Armee des Osmanischen Reichs hierher. Motovunski Novaki verfiel nach der venezianischen Herrschaft der bekannten Familie Polesini, welche hier einen Palast erbaute, von welchem nur das Portal erhalten geblieben ist.
Die Pfarrkirche der Hl. Marina in Motovunski Novaki wurde im Jahre 1879 an Stelle der älteren aus dem 16. Jahrhundert erbaut.